Uma vez que a relação sexual é a principal forma de transmissão do HPV, o comportamento sexual é o maior determinante da infecção genital por HPV. Assim, o início precoce das relações sexuais, parceiros sexuais múltiplos e parceiros que tenham múltiplas parceiras sexuais são fatores de risco significativos para infecção por HPV.

Métodos para diagnosticar lesões características associadas ao HPV incluem inspeção visual, citologia (exame de Papanicolaou), colposcopia, vulvoscopia, peniscopia, histologia (biópsia) e exames laboratoriais para detecção do DNA do HPV.

Nas mulheres, o HPV ocorre com maior frequência na vulva, na vagina, no períneo e na região perianal. Embora ele possa se desenvolver na cérvice uterina, é de ocorrência relativamente rara.